临床医学二系成立于建院伊始。主要承担着学院的部分临床课程的理论教学、见习带教和实习带教任务。下设十一个教研室：内科学教研室、外科学教研室、妇产科学教研室、儿科学教研室、急救医学教研室、神经精神病学教研室、眼科学教研室、耳鼻咽喉科学教研室、口腔科学教研室、皮肤性病学教研室、中医学教研室。
　　我系实行的是系院合一的管理模式。临床医学二系建系初，医院各方面工作都处于起步阶段，任务重、人员少。全院职工发扬和继承白求恩无私奉献精神和太行老区艰苦创业的精神，以“救死扶伤，教书育人”为办院宗旨，并根据学院指示相继成立了各级教学机构，对教学管理人员进行了系统培训。规范临床教学过程，严抓教学质量管理，从细节入手，从基础抓起，为我系承担和完成学院交给的教学任务打下了良好的基础。
　 自1999年8月建院至今五个年头过去了，现在展现给社会的是一个“全国百姓放心示范医院”，一个环境幽雅的“园林化医院”，一个为太行老区服务的附属医院。临床医学二系已经取得了长足的进步，全系师生将团结一致，顽强拼搏，与时俱进，开拓创新，圆满完成学院下达的各项任务，不断提高教学质量，培养合格的医学人才。